事務長代行サービス比較18選｜料金・業務範囲・選び方を解説【2026年】

事務長代行とは、診療以外の経営業務を外部に任せる仕組み

事務長代行とは、クリニックや医療法人で事務長が担う業務を、外部の事業者に委託するサービスです。人事労務、経理、採用、行政手続きのサポート、集患のためのWeb運用まで、診療以外の経営まわりの実務をまとめて引き受けます。

常勤の事務長を雇うのではなく、必要な業務だけを必要な頻度で任せられる点が特徴です。訪問して院内に入るタイプもあれば、オンラインだけで完結するタイプもあります。

院長が診療の合間に行政への届出を確認したり、求人原稿を書いたり、スタッフの面談日程を調整したりしている状態を解消するための選択肢、と考えるとわかりやすいかもしれません。

事務長代行が必要になるタイミング

事務長代行の導入が検討されるのは、おおむね次のような場面です。

• 院長の時間が診療以外に取られている — 行政手続き、スタッフ対応、業者との交渉・IT関連の設定等が診療後や休診日に食い込んでいる
• スタッフが増えて労務管理が回らなくなった — 人数が10名を超えたあたりから、シフト、評価、面談の負荷が急に上がります
• 常勤の事務長を雇うほどの業務量ではない — 週5日分の仕事はないが、院長が片手間でやるには重い
• 分院の開設や法人化を控えている — 一時的に実務が増えるが、そのために人を採用すると終了後に持て余す
• 事務長が退職した — 後任が決まるまでの期間を埋める必要がある

このうち常勤を雇うほどではないが、事務長代行がもっとも選ばれる理由です。

事務長代行に任せられる業務・任せられない業務

任せられる業務

各社の対応範囲を調べた限り、共通して対応しているのは次の領域です。行政手続は独占業務になるため直接の代行は行政書士等の士業・士業法人でないと代行できません。そのため各社必要な手続きの洗い出し・士業への連絡などのサポートとなります。

• 人事労務 — 勤怠集計、シフト作成、就業規則の整備、スタッフ面談、評価制度の設計
• 採用 — 求人原稿の作成、媒体の選定、応募者対応、面接日程の調整
• 経理 — 記帳、支払管理、給与計算、会計事務所との窓口
• 行政手続き — 保険医療機関の各種届出、施設基準の管理、更新手続きのサポート
• 集患・広報 — ホームページの更新、SNS運用、口コミ対応、広告の管理
• 庶務 — 業者との交渉、備品発注の一元化、契約の見直し

任せられない業務

一方で、外部に出せない業務もあります。

• 診療行為と医学的判断 — 当然ながら委託できません
• 保険請求の最終責任 — レセプトの作成支援は任せられますが、請求は保険医療機関の名義で行われるため、内容に対する最終的な責任は医療機関に残ります
• 最終的な経営判断 — 分析や提案は受けられますが、決めるのは院長です

どこまでを外に出し、どこから院内に残すのかを先に決めておくことが、導入がうまくいくかどうかの分かれ目になります。

事務長代行と医療事務代行はどう違うのか

混同されやすいのですが、この2つは守備範囲が違います。

レセプト業務が滞っているなら医療事務代行、院長が診療以外の判断と手続きに追われているなら事務長代行、という切り分けになります。両方に課題がある場合は、どちらから手をつけるかを決めてから相談した方が、見積もりの精度が上がります。

関連記事：医療事務代行とは？外注できる業務内容やメリット、注意点を解説

事務長代行の費用｜月額だけを並べても比較になりません

課金方式は3種類に分かれます

18社を調べて最初に分かったのは、料金の決まり方が揃っていないことです。大きく3種類あります。

公開されている金額を並べると月額30,000円から1,100,000円まで35倍以上の開きがありますが、これは「安い・高い」の差ではなく、何を買っているかが違うことによる差です。

比較サイトでは相場は月額10万〜20万円、と書かれていることがありますが、実際のレンジを見る限り、単一の相場を示すこと自体があまり意味を持ちません。

時間単価に揃えると比べられます

時間制のサービスは、時間単価に直すと横並びで比較できます。

時間単価が安い順に並べると、次のようになります。

※SABUは歯科医院専門のため、医科クリニックは対象外です。各社公式サイトおよび比較メディアの公開情報（2026年10月時点）

ここで注目したいのが、月額の順番と時間単価の順番が一致しない点です。月額だけを見れば「SABU MINI 93,500円」が「レンタル事務長さん ミニマム 110,000円」より安く見えますが、どちらも時間単価では8,000円前後で大きな差はありません。一方、月額148,500円のSABUスタンダードは時間単価5,940円と、月額の低いプランより割安です。

時間数を公表しているサービス自体がまだ少ないため、この表に載せられたのは3社のみです。裏を返せば、見積もりの際に「月何時間分か、どれくらいの業務量が可能か」を聞くだけで、他院が比較できていない軸で判断できるということでもあります。

一般に、契約時間数が多いプランほど時間単価は下がります。見積もりを取るときは、必ず月あたりの稼働時間を確認してください。

訪問回数制の場合は、1回の訪問が何時間かを確認すると、同じように比較できます。

常勤の事務長を雇う場合との比較

事務長代行を検討する院長が本当に知りたいのは、人を雇う場合と比べてどうかということだと思います。

業界メディアや求人情報を見ると、クリニックの事務長の年収はおおむね500万〜700万円程度とされることが多く、経験や役割によってはそれ以上になることもあります。ただし、実際に医療機関が負担する額は給与だけではありません。

• 社会保険料の事業主負担 — おおむね給与の15〜16%が上乗せされます
• 採用コスト — 求人広告費または人材紹介手数料。紹介の場合は想定年収の数十パーセントが一般的です
• 教育コスト — 入職後、クリニックの事情を把握して独力で回せるようになるまでの期間

年収600万円の事務長を雇う場合、社会保険料の事業主負担だけで年間90万円前後が上乗せされ、実質的な負担は年700万円近く、月あたりおよそ58万円という計算になります。ここに採用費と教育期間が加わります。

事務長代行の料金と単純比較はできませんが、月50万円を超えるあたりが、常勤を雇う場合との損益分岐の目安になります。それ以下の業務量であれば、代行の方が合理的な場合が多くなります。

あわせて考えたいのが、1人に依存するリスクと人間関係のリスクです。常勤の事務長が1人の場合、その人が退職すると業務とノウハウが同時に失われます。また狭い人間関係で、合わない人が入ればギクシャクすると言ったリスクも存在します。代行であれば事業者側の体制で継続されます。

クリニック向け事務長代行サービス比較18選

調査時点で公開されている情報をもとに18社を紹介します。掲載順は課金方式ごとの分類で、1〜3が時間制、4〜7が訪問回数制、8〜9が駐在型、10〜12が月額定額・オンライン中心、13〜18が料金非公開のサービスです。優劣を示すものではありません。料金は税込・税別の表記が各社で異なるため、記載があるものはそのまま記しています。

なお2・17・18の3社は歯科医院専門で、医科クリニックは対象外です。

1.レンタル事務長さん

2.株式会社SABU

3.Remoba医療事務

4.クリニックマネージャー

5.ROOTS株式会社

6.リモートジムキョク

7.事務長代行（成迫会計事務所）

8.セトルメディカル

9.プチ事務長

10.事務長代行＆クラウド事務長

11.院外事務長サポート

12.クレド事務長代行

13.クリニック事務長業務代行

14.事務長代行サービス

15.事務長代行（メディカ・コンサルティング）

16.事務長代行（国道ビル）

17.歯科医院外部事務長

18.歯科事務長代行

事務長代行を選ぶときの確認項目

1. 月あたりの稼働時間、または訪問回数

前述のとおり、月額だけでは比較になりません。時間制なら月何時間か、訪問制なら1回何時間の訪問が何回か。ここを揃えないと高い安いの判断ができません。

2. 業務範囲に労務・経理が含まれるか

同じ「事務長代行」でも、Web集患やSNS運用が中心のサービスと、労務・経理・行政手続きまで含むサービスでは中身がまったく違います。月額5万円台と30万円台を並べて比べても意味がないのは、この差があるためです。

あわせて確認したいのが、自院の診療形態が対象に入っているかです。今回調べた18社のうち、株式会社SABU、株式会社バタフライエフェクト、株式会社インダストリーの3社は歯科医院専門で、医科クリニックは対象外です。逆に歯科医院であれば、歯科特有の事情（リコール管理、自費メニュー、訪問歯科など）を理解している専門サービスの方が話が早く進みます。

3. 対応エリアと訪問の可否

調査した18社のうち、全国対応を明記しているのはオンライン中心のサービスが中心です。訪問を前提とするサービスは関東、関西、九州など拠点周辺に限られます。

地方のクリニックで訪問を希望する場合、選択肢はかなり絞られます。逆に、オンラインで足りる業務であれば全国どこからでも依頼できます。

4. 担当者の体制

1人の担当者が全業務を見るのか、分野ごとに担当が分かれるのか。分業制は専門性が高い一方、窓口が増えます。担当者が交代したときの引き継ぎ体制もあわせて確認してください。

5. 契約期間と解約条件

最低契約期間が設定されているサービスがあります。初期費用を複数月に分けて請求する形もあるため、短期間で見直す可能性がある場合は確認が必要です。

6. 医療機関での実務経験があるか

医療機関の事務長経験者が担当するサービスもあれば、一般企業のマネジメント経験を強みとするサービスもあります。施設基準や保険請求まわりの判断を任せたい場合は、前者の方が話が早く進みます。

事務長代行が向かないクリニック

正直なところ、すべてのクリニックに必要なサービスではありません。次のような場合は、導入しても効果が出にくくなります。

• 院長が業務を手放す意思がない — 最終的な判断は院長に残りますが、日々の実務まで院長が確認する運用では、かえって手間が増えます
• 任せたい業務が言語化できていない — 「なんとなく忙しい」の状態で依頼すると、何を頼むかの整理から始まり、費用に見合いません。まず1週間、院長が診療以外に使っている時間を書き出すところからをおすすめします
• スタッフ数が少なく、業務量自体が小さい — 労務や採用の発生頻度が低ければ、顧問社労士や税理士で足りる場合があります
• 求めているのが医療事務の人手 — 受付やレセプトが回らないという課題なら、事務長代行ではなく医療事務代行が適しています

関連記事：医療事務の人手不足の現状とその原因とは？改善するための方法を解説

よくある質問

Q.事務長代行の費用はいくらですか

公開されている料金は月額30,000円から1,100,000円まで幅があります。これは課金方式（時間制・訪問回数制・駐在型）と業務範囲の違いによるものです。労務・経理・採用まで含む一般的なプランであれば、月額10万〜30万円程度が中心的な価格帯になります。

Q.常勤の事務長を雇うのとどちらが安いですか

業務量によります。クリニックの事務長の年収はおおむね500万〜700万円が相場で、これに社会保険料の事業主負担が15〜16%上乗せされるため、年収600万円なら実質的な負担は月58万円程度です。代行の費用がこれを下回り、かつ必要な業務が範囲に収まるのであれば、代行の方が合理的です。

Q.オンラインだけでも頼めますか

可能です。Remoba、クレド事務長代行、メディカルサポートパートナー（クラウド型）、ジムチョー（リモートジムキョク）などがオンライン中心のプランを持っています。労務書類の作成、採用、Web運用などは訪問なしでも進められます。一方、スタッフ面談や現場の業務フロー改善は訪問型の方が向いています。

Q.契約してすぐに効果は出ますか

業務の棚卸しと引き継ぎに1〜2ヶ月程度かかるのが一般的です。院内のルールや取引先、スタッフの状況を把握してもらう期間が必要になります。短期間で判断せず、最低でも3ヶ月は様子を見た方がよいでしょう。

Q.医療事務代行と併用できますか

できます。事務長代行は経営・管理領域、医療事務代行は受付やレセプトなどの診療実務が守備範囲なので、重複しません。ただし窓口が2社に分かれるため、どちらに何を依頼するかの線引きは明確にしておく必要があります。

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Q.途中で業務範囲を変えられますか

多くのサービスがプラン変更に対応しています。時間制のサービスは時間数の増減、訪問制は回数の増減で調整します。開業直後や法人化の時期だけ厚くして、落ち着いたら戻すといった使い方も可能です。契約時に変更の条件を確認しておくと安心です。

まとめ

事務長代行を比較するときは、次の3点を押さえてください。

1. 月額ではなく、時間単価または訪問1回あたりの単価で比べる — 課金方式が揃っていないため、月額の数字だけでは判断を誤ります
2. 業務範囲に、自院が困っている領域が入っているか確認する — Web集患特化と労務・経理まで含むサービスが同じ「事務長代行」の名前で並んでいます
3. 常勤を雇う場合の実質負担と比べる — 年収600万円の事務長なら社会保険料込みで月58万円程度。これが一つの目安になります

そのうえで、自院の課題が「経営判断まわりの相談相手がほしい」のか「診療まわりの実務が回っていない」のかを切り分けてください。前者であれば訪問型の事務長代行、後者であれば医療事務を軸にしたオンライン型が向いています。

Remobaは後者を得意としています。医療事務（受付・予約管理、レセプト、電子カルテ・オンライン診療サポート、会計対応）を時間制で引き受け、経理・人事労務・採用についてもそれぞれ専門チームが対応します。必要な領域だけを組み合わせて依頼できるため、「事務長を置くほどではないが、診療以外が回らない」という段階に適しています。どの範囲を任せるべきか迷う場合は、Remoba医療事務のサービスページもあわせてご覧ください。